Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SETD1BQ9UPS6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SETD1BQ9UPS6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms