Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF2Q9UNY4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms