Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms