Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MLH3Q9UHC1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MLH3Q9UHC1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms