Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFDP1Q9UEE9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms