Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM8A1Q9UBU6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM8A1Q9UBU6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms