Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms