Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAPAQ9P0L0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms