Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms