Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC28Q9NX36 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms