Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT57Q9NWB7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms