Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC87Q9NVE4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC87Q9NVE4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms