Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX15Q9NRS6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX15Q9NRS6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms