Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms