Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHK2Q9NRA0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms