Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MEPEQ9NQ76 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms