Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR6Q9HBX8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms