Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL4Q9C0H6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms