Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMBRA1Q9C0C7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMBRA1Q9C0C7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms