Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms