Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms