Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms