Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C2orf88Q9BSF0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C2orf88Q9BSF0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C2orf88Q9BSF0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms