Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms