Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3CQ99985 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms