Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHOX2BQ99453 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms