Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPS6KC1Q96S38 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPS6KC1Q96S38 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms