Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A9Q96Q91 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms