Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMTM3Q96MX0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMTM3Q96MX0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms