Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN37Q96GY3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms