Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC59Q96AG4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms