Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD1Q969G9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms