Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSH3Q8TE77 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSH3Q8TE77 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms