Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CLDN19Q8N6F1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN19Q8N6F1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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