Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms