Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms