Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VSTM1Q6UX27 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms