Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC41PQ6P2S7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms