Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRNP1Q6NT89 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms