Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms