Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF123Q5XPI4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF123Q5XPI4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms