Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRAMEF20Q5VT98 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms