Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRIP1Q5VSL9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRIP1Q5VSL9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms