Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGSNQ5TDP6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGSNQ5TDP6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LGSNQ5TDP6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGSNQ5TDP6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGSNQ5TDP6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGSNQ5TDP6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms