Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HP1BP3Q5SSJ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HP1BP3Q5SSJ5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HP1BP3Q5SSJ5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HP1BP3Q5SSJ5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HP1BP3Q5SSJ5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HP1BP3Q5SSJ5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms