Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP100Q494V2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms