Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms