Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWISTNBQ3B726 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms