Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms