Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCSK7Q16549 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms